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荧光定量pcr仪做蛋白质热稳定性分析实验
2024-06-28 15:24:15 作者: 高思维医疗 651

研发类实验室常常涉及到功能蛋白质热稳定性分析及蛋白质间相互作用的分析。比如在科研中对蛋白纯化、结晶和功能鉴定中要选择稳定蛋白的配体或缓冲条件;科研或工业上选择蛋白较好的储存条件;药物开发中对配体或药物靶点进行高通量筛选。针对以上研究领域,一种稳定高效高通量的研究方法正在被相关研究者广泛采用,即FRET蛋白质热稳定性分析。

Bio-Rad针对蛋白热稳定性分析实验,提供完整的解决方案。该方案采用差示扫描荧光(differential scanning fluorimetry,DSF)技术:反应体系中加入荧光疏水染料Sypro Orange,蛋白自有疏水区结构,在缓慢升温的过程中,蛋白的结构会被打开,暴露出疏水区,荧光疏水染料Sypro Orange就可以与该区域进行特异性结合,设备提供该反应的温度变化及荧光信号采集,类同于荧光定量pcr反应。


DSF技术原理

在有特定化合物或配体结合的情况下,蛋白稳定性会发生变化,表现为熔解温度的变化。不同蛋白将有着不同的thermal shift(蛋白热熔解曲线)图像,每一个都有独特的熔解曲线形状、斜率和温度熔解范围。据此特性,可借助荧光定量PCR仪来进行该实验。前提是荧光定量PCR仪具备Sypro Orange特异的激发检测通道。

Bio-Rad Opus系列荧光定量PCR仪自带专用检测通道FRET,激发光波长450-490nm,发射光波长560-580nm,正适合于用SYPRO Orange荧光染料标记进行蛋白溶解曲线分析。在荧光定量PCR仪上缓慢加热蛋白质样品,在加热的过程中检测荧光染料与结构发生改变的蛋白质相结合的量,来评价蛋白质的热稳定性.该方法具有数据准确,高通量,蛋白质样品损耗较小和温度变化范围广的优点,应用领域包含:

(1)筛选样品蛋白热稳定性;

(2)高通量筛选配体与蛋白的结合;

(3)筛选能与蛋白靶点结合的小分子、片段文库候选药物;

(4)筛选能与蛋白靶点结合的抗体;

(5)筛选点突变后样品的蛋白稳定性变化;

(6)寻找合适/缓冲液条件,以测定蛋白与配体间相互作用;

(7)寻找合适缓冲液条件,以改善蛋白的纯化、分离;

(8)筛选合适/缓冲液,以鉴定成功的蛋白结晶条件;

(9)筛选缓冲液,以鉴定出蛋白储存条件。

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