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PCR扩增的增强剂和抑制剂有哪些?
01增强剂
1. 激活剂:激活剂通过改善聚合酶的活性,让整个PCR过程焕发活力。10~100ug/ml BSA(牛血清白蛋白)就能在某些情况下提升聚合酶的稳定性和活性。
2. 保护剂:保护剂的作用在于防止模板DNA降解,确保DNA的完整性。如T4基因32蛋白能保护单链DNA不受核酸酶攻击。
3. 增效剂:增效剂能够提高引物与模板间的亲和力,从而提升扩增的特异性。1%~10%DMSO(二甲基亚砜)就是一种常用的增效剂,能使PCR反应在较高温度下进行,有助于解决模板二级结构引起的问题。
4. 促进剂:促进剂填补反应体系中的空隙,为聚合酶提供适宜的工作环境。例如,5%~20%甘油或1.25%~10%甲酰胺可以在某些困难的扩增中作为促进剂使用。
5. 净化剂:净化剂清除可能干扰PCR反应的杂质。例如,某些特殊的蛋白酶抑制剂可以防止样本中的蛋白酶干扰反应。
6. 调节剂:调节剂负责微调PCR反应的各项参数,如离子浓度等。Mg^2+浓度的适当调整就能显著影响PCR的特异性和产量。
7. 链接剂:链接剂加固引物与模板之间的连接。比如,有些特定的寡核苷酸可用作“锁式探针”,与目标序列形成稳固的结构,以辅助扩增。
02抑制剂
SDS:离子去污剂,0.01%即可完全抑制PCR反应,0.005%可显著降低产量
苯酚:0.5%即可完全抑制PCR反应,0.2%可显著降低产量
乙醇:大于1%的浓度可抑制PCR反应,但在某些体系里又能增加产量
异丙醇:抑制作用比乙醇稍强
乙酸钠:大于5mM时抑制PCR反应
氯化钠:大于25mM时抑制PCR反应(生理盐水无影响)
EDTA:0.5mM可使PCR产物减少,1mM完全没有PCR产物
血红素(heme)-来源:血液,大于1mg/ml抑制PCR反应
氯高铁血红素(hemin):大于0.1ng/μl抑制PCR反应
丹宁酸(tannic acids):大于0.1ng/μl抑制PCR反应
肝素:大于0.15IU/ml抑制PCR反应
尿素-来源:尿,大于20mM时产生抑制
腐殖质-来源:土壤,植物材料,自然界水
植物多糖-来源:粪便,植物多糖
聚苯乙烯,聚丙烯-来源:紫外线照射塑料管
胆酸盐-来源:粪便
胶原质-来源:组织
靛青染料-来源:粗斜纹棉布,牛仔裤
蛋白酶-来源:牛奶
钙离子-来源:牛奶,骨头
铁离子-来源:血液
二甲苯胺
溴酚兰
胆红素(bilirubin)
其他抑制剂
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