在选择二氧化碳培养箱的气套和水套时，需要考虑实验需求、温度控制稳定性、加热速度、操作简便性以及预算等多个因素。以下是对气套式和水套式二氧化碳培养箱的详细比较，以帮助做出合适的选择：

一、温度控制稳定性

水套式：由于水的比热容大，水套式培养箱在断电或其他突发情况下能更长久地保持培养箱内的温度准确性和稳定性，维持温度恒定的时间是气套式系统的4~5倍。如果实验对温度稳定性要求极高，如长时间的细胞培养实验，且实验环境不太稳定，存在用电限制或经常停电等情况，水套式二氧化碳培养箱是更好的选择。

气套式：其温度恢复比水套式培养箱迅速，在箱门频繁开关导致温度经常性改变的情况下，能够快速使箱体内温度恢复稳定，有利于短期培养以及需要频繁开关箱门的实验。

二、操作简便性

水套式：需要对水箱进行加水、清空和清洗，并要经常监控水箱运作情况，操作相对复杂。而且如果使用错误类型的水，培养箱可能会生锈，导致维修成本增加。

气套式：设计相对简单，无需进行与水套相关的复杂操作，使用起来更加便捷，也不存在因水的问题导致生锈的风险。

三、灭菌与维护

水套式：一般无法进行高温干热灭菌，通常采用化学消毒剂擦拭、紫外线照射等方式进行消毒灭菌，但这些方法可能存在消毒不彻底的情况。

气套式：许多气套式二氧化碳培养箱配备了高温干热灭菌系统，可对箱体进行定期灭菌，能有效减少污染风险，维护更加洁净的培养环境。

四、实验需求与使用环境

实验需求：如果实验需要长时间维持温度的恒定，且实验环境不太稳定或存在用电限制，建议选择水套式培养箱。如果实验需要快速加热和温度恢复，且对温度稳定性的要求不是特别高，可以选择气套式培养箱。

使用环境：在实验室供电稳定的前提下，气套式培养箱可能更为合适。因为水套式培养箱在断电情况下能够维持温度一段时间，但在持续供电的情况下，其加热速度较慢的缺点可能会显现出来。而气套式培养箱则能够迅速加热和恢复温度，更适合频繁开关门或需要快速调整温度的实验场景。

综上所述，选择水套式培养箱还是气套式培养箱需要根据实验的具体需求、使用环境的稳定性以及预算和维护成本等多个因素进行综合考虑。